Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIT3O14879 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms