Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX2A6NKB5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms