Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC5DA1L4H1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms