Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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