Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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