Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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