Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CCDC142Q17RM4 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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