Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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