Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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