Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms