Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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