Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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