Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
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