Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms