Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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