Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PTPRMP28827 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRMP28827 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRMP28827 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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