Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PTPRDP23468 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PTPRDP23468 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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