Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms