Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms