Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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