Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SHOC2Q9UQ13 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms