Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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EHD3Q9NZN3 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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EHD3Q9NZN3 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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EHD3Q9NZN3 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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EHD3Q9NZN3 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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