Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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FOXQ1Q9C009 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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