Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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