Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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VAMP3Q15836 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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