Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RUNX3Q13761 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms