Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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TCIRG1Q13488 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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