Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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