Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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TCOF1Q13428 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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TCOF1Q13428 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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TCOF1Q13428 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TCOF1Q13428 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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