Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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AP3B2Q13367 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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AP3B2Q13367 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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AP3B2Q13367 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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AP3B2Q13367 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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AP3B2Q13367 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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