Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRMP28827 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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