Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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EHD3Q9NZN3 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EHD3Q9NZN3 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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