Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRIQ1Q96JM4 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRIQ1Q96JM4 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms