Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms