Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYNE4Q8N205 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SYNE4Q8N205 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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SYNE4Q8N205 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYNE4Q8N205 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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