Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms