Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms