Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms