Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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