Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms