Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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