Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ALCAMQ13740 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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