Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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