Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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