Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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