Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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