Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TMPOP42166 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TMPOP42166 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TMPOP42166 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TMPOP42166 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TMPOP42166 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TMPOP42166 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMPOP42166 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TMPOP42166 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TMPOP42166 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TMPOP42166 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TMPOP42166 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms