Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PTPRMP28827 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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PTPRMP28827 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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