Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
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HOXD10P28358 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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HOXD10P28358 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD10P28358 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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