Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPREP23469 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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